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新冠病毒的进化速度

文/司大勇 2020-03-26 14:17:33 来源:中国网医疗频道

新冠病毒在进化,突变速度较稳定,每个月突变几个RNA核苷酸位点,但精确计算不容易。

已发表的新冠病毒序列有不到两千条。下图是不同国家一共1249个病毒序列的突变关系图。

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颜色代表国家地区。

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我们可以发现,无论什么国家,周围的病毒似乎都围绕着中间的几种病毒,呈 众星捧月之势。我们可以猜测,中间的几个病毒是比较早的病毒,周围都是他们的孩子。

我们把病毒分成三组,分别观看。

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上图第一组是1月19日以前的病毒,多数都是中国发病的病毒,而且比较靠中间。

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上图第二组是1月20日-2月21日的病毒,中间和四周病毒都有,但是最远两个树枝还是空的。

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上图第三组是2月22日-3月25日的病毒,外国病毒占多数,中间病毒变少,最远两个树枝布满。

由上面几张图,任何一个人都会发现这个简单的规律,就是病毒的确在突变(进化),由中间向四周慢慢扩散,而且速度比较稳定,大概一个月能走几步。也就是说,每个月突变几个RNA核苷酸位点!(不考虑插入缺失这种突变,只考虑了碱基替换)。恭喜大家,已经发现了新冠病毒的突变速度!是不是只需要目测,就看出来了?


另外,画一张图,横坐标是时间,纵坐标是突变数,看斜率,就是突变速度拉,也就是下图

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但是上面这个图有点小问题:

上面我写过,最早的病毒有好几种,都在中间,离得不远,差了几个碱基。我们不知道最早的病毒是哪个(我推测,最早的病毒应该不是他们中的任何一个)。所以计算每个病毒的突变数的时候,就算不准。这样一来,想精确计算突变速度和病毒起源时间,就不太可能了。所以上图左边推算的时间是不对的。

最后以送瘟神一诗结尾:

绿水青山枉自多,

华佗无奈小虫何! 

千村薜荔人遗矢,

万户萧疏鬼唱歌。

坐地日行八万里,

巡天遥看一千河。

牛郎欲问瘟神事,

一样悲欢逐逝波。

春风杨柳万千条,

六亿神州尽舜尧。

红雨随心翻作浪,

青山着意化为桥。

天连五岭银锄落,

地动山河铁臂摇。

借问瘟君欲何往,

纸船明烛照天烧。


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